Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cog1Q9Z160 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms