Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hmg20bQ9Z104 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hmg20bQ9Z104 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms