Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NgfrQ9Z0W1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NgfrQ9Z0W1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NgfrQ9Z0W1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NgfrQ9Z0W1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NgfrQ9Z0W1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NgfrQ9Z0W1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NgfrQ9Z0W1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NgfrQ9Z0W1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms