Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Xpr1Q9Z0U0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xpr1Q9Z0U0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms