Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnip1Q9WUU8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms