Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pus1Q9WU56 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pus1Q9WU56 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pus1Q9WU56 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Pus1Q9WU56 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pus1Q9WU56 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms