Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrf1Q9WU00 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms