Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema6cQ9WTM3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms