Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc2Q9R244 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms