Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sorbs3Q9R1Z8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms