Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma1Q9R1P4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma1Q9R1P4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms