Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf7Q9R1C0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Taf7Q9R1C0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms