Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M6

Rab9a, Ras-related protein Rab-9A, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab9aQ9R0M6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab9aQ9R0M6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rab9aQ9R0M6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rab9aQ9R0M6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rab9aQ9R0M6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms