Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms