Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc6Q9R087 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc6Q9R087 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms