Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
BcamQ9R069 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BcamQ9R069 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms