Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Fhl3Q9R059 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms