Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClnkQ9QZE2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms