Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms