Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phtf1Q9QZ09 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms