Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR7

Acot3, Acyl-coenzyme A thioesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot3Q9QYR7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acot3Q9QYR7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acot3Q9QYR7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acot3Q9QYR7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acot3Q9QYR7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acot3Q9QYR7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acot3Q9QYR7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acot3Q9QYR7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Acot3Q9QYR7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms