Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tomm40Q9QYA2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tomm40Q9QYA2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms