Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nphp1Q9QY53 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms