Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms