Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf354bQ9QXT9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf354bQ9QXT9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf354bQ9QXT9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf354bQ9QXT9 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf354bQ9QXT9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf354bQ9QXT9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf354bQ9QXT9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf354bQ9QXT9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Znf354bQ9QXT9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Znf354bQ9QXT9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf354bQ9QXT9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms