Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limd1Q9QXD8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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