Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms