Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms