Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vstm2bQ9JME9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms