Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Crlf1Q9JM58 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf1Q9JM58 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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