Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pole3Q9JKP7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pole3Q9JKP7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms