Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms