Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnga3Q9JJZ8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms