Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc12a4Q9JIS8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc12a4Q9JIS8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc12a4Q9JIS8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms