Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sv2aQ9JIS5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sv2aQ9JIS5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms