Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp1r3fQ9JIG4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms