Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copb1Q9JIF7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Copb1Q9JIF7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms