Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus3Q9JI38 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pus3Q9JI38 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pus3Q9JI38 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms