Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr3bQ9JHJ5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr3bQ9JHJ5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Htr3bQ9JHJ5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Htr3bQ9JHJ5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Htr3bQ9JHJ5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Htr3bQ9JHJ5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr3bQ9JHJ5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Htr3bQ9JHJ5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms