Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Tmod3Q9JHJ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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Tmod3Q9JHJ0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Tmod3Q9JHJ0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Tmod3Q9JHJ0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Tmod3Q9JHJ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Tmod3Q9JHJ0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod3Q9JHJ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod3Q9JHJ0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod3Q9JHJ0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod3Q9JHJ0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod3Q9JHJ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod3Q9JHJ0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod3Q9JHJ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod3Q9JHJ0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod3Q9JHJ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod3Q9JHJ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod3Q9JHJ0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod3Q9JHJ0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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