Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp6Q9ESX2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp6Q9ESX2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp6Q9ESX2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp6Q9ESX2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp6Q9ESX2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp6Q9ESX2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp6Q9ESX2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp6Q9ESX2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp6Q9ESX2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sp6Q9ESX2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sp6Q9ESX2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sp6Q9ESX2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sp6Q9ESX2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp6Q9ESX2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms