Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp29Q9ES63 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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