Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trhr2Q9ERT2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trhr2Q9ERT2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms