Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slco1c1Q9ERB5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms