Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Tpcn1Q9EQJ0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Tpcn1Q9EQJ0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Tpcn1Q9EQJ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Tpcn1Q9EQJ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Tpcn1Q9EQJ0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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