Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndst3Q9EQH7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms