Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms