Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pold3Q9EQ28 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold3Q9EQ28 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold3Q9EQ28 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms