Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1lQ9EQ00 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms