Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPZ6

Tbx18, T-box transcription factor TBX18, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx18Q9EPZ6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbx18Q9EPZ6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbx18Q9EPZ6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tbx18Q9EPZ6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tbx18Q9EPZ6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tbx18Q9EPZ6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbx18Q9EPZ6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms